Asesmen lapangan dilaksanakan di gedung Fakultas Ekonomi dan Bisnis Islam (FEBI) kampus 2 IAIN Pekalongan, yang merupakan kampus baru. Akreditasi institusi kali ini adalah yang kedua diselenggarakan. Sebelumnya pada 13-15 Juni 2015 juga dilaksanakan akteditasi institusi ketika IAIN masih berstatus Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri Pekalongan.

Bertindak sebagai asesor adalah Prof. Dr. Arifuddin Ahmad, M.Ag. (Universitas Islam Negeri  Aludin Makassar) ,Dr. Lantip Diat Prasojo, M.Pd. ( Universitas negeri Yogyakarta), Dr. Syaifan Nur, MA. (Universitas Islam Negeri Sunan Kalijaga), dan Dr. Atiyatul Ulya, MA (Universitas Islam Negeri Syarif Hidayatullah.

Menurut ketua tim penyusun borang AIPT, Dr. H. Muhlisin, M.Ag yang sekaligus sebagai Wakil Rektor I Bidang Akademik dan kelembagaan, bahwa tujuan akreditasi ini adalah menentukan standar mutu dan penilaian IAIN Pekalongan. Karena akreditasi adalah upaya untuk menstandardisasi dan menjamin mutu lembaga secara keseluruhan.

Acara pembukaan diselenggarakan di meeting room gedung FEBI dengan dihadiri oleh tim asesor, pimpinan IAIN Pekalongan, dosen, alumni. Dimulai pada pukul 08.00 WIB dengan pembukaan, dilanjutkan sambutan Rektor IAIN Pekalongan, sambutan Ketua Tim Asesor, dan penutup perwakilan kemenag, dan stakeholder diantaranya pengguna lulusan yang terdiri dari beberapa perusahaan, dan lembaga pendidikan. Kemudian, acara visitasi diserahkan kepada lead asesor. Oleh lead asesor, Rektor IAIN diminta untuk mempresentasikan singkat mengenai perkembangan dan kemajuan yang dicapai oleh IAIN Pekalongan yang kemudian dilanjutkan penilaian atau asesmen lapangan.

Penilaian ini dilakukan dengan mengecek bukti, terutama bukti fisik yang terdapat di dalam borang akreditasi. Dalam penilaian itu, asesor mewawancarai para mahasiswa yang terdiri dari para perwakilan mahasiswa masing–masing proram studi (prodi), para alumni, user, dan juga perwakilan dosen. Tim visitasi juga melakukan kunjungan ke fasilitas-fasilitas penting yang ada di IAIN Pekalongan yang menjadi bukti fisik kelayakan dan perkembangan instansi, seperti; perpustakaan, laboratorium, microteaching, gedung Pascasarjana, ruang-ruang pengelola jurusan, ruang kelas, dan ruang dosen.